Ngoài nguy cơ gây dị tật bẩm sinh và tổn thương gan, Bosentan có nguy cơ cao gây phù, tắc tĩnh mạch phổi, giảm số lượng tinh trùng và giảm hemoglobin và hematocrit.[1][2]

Các tác dụng phụ rất phổ biến (xảy ra ở hơn 10% số người) bao gồm đau đầu, tăng transaminase và phù. Các tác dụng phụ thường gặp (từ 1% đến 10% ở người) bao gồm thiếu máu, giảm huyết sắc tố, phản ứng quá mẫn, viêm da, ngứa, nổi mẩn, đỏ da, đỏ bừng, ngất, tim đập nhanh, huyết áp thấp, nghẹt mũi, trào ngược dạ dày bệnh và tiêu chảy.[1][2]